제1대 학장 전희철
- 감리교대전신학원 초대교장
- 감리교대전신학교장
제2~3대 학장 이호운
- 감리교대전신학교장
- 감리교대전신학대학장
제4~8대 학장 남기철
- 감리교대전신학대학장
- 목원대학장
제9대 학장 김하태
(1984. 09. 24 ~ 1985. 07. 11)
제10대 학장 이군호
- 목원대학장
제11대 학장, 초대,2대 총장 박봉배
(1990. 03. 23 ~ 1993. 02. 28)
(1993. 03. 01 ~ 1994. 03. 15)
(1994. 03. 16 ~ 1995. 10. 02)
제3대 총장 유근종
(1995. 10. 03 ~ 1998. 03. 15)
제4대 총장 이군호
(1998. 03. 16 ~ 2002. 02. 28)
제5대 총장 유근종
(2002. 09. 13 ~ 2005. 06. 30)
제6대 총장 이요한
(2006. 09. 01 ~ 2010. 08. 31)
제7대 총장 김원배
(2010. 09. 01 ~ 2014. 08. 31)
제8대 총장 박노권
(2014. 09. 01 ~ 2018. 08.31)
제9대 총장 권혁대
(2018. 09. 01 ~ 2022. 08. 31)